人物

郑基深

郑基深

  • 国籍:中国
  • 出生地:广西桂林
  • 民族汉族学业信息毕业院校:中国科学技术大学
  • 学历:博士
  • 职称:研究员
  • 郑基深介绍
    郑基深,中国科学技术大学,微尺度物质科学国家研究中心,研究员。获得中国科学技术大学的本科和博士学位,清华大学博士后,曾为中科院强磁场中心副研究员。主要研究方向是膜蛋白重构与调控,通过发展可脱除骨架修饰(RBM,Removable Backbone Modification)策略,完成了一系列重大疾病密切相关的中小型功能膜蛋白体外重构,并通过镜像噬菌体筛选等异种蛋白质工程技术(Xenoprotein engineering),发现新的膜蛋白探针和活性分子/药物前体分子。

    人物介绍

    微尺度物质科学国家研究中心 分子与细胞生物物理研究部 研究员[1]

    中国科学技术大学 生命科学学院 研究员

    2002年至2012年就读于中国科学技术大学化学与材料科学学院,获得理学学士和博士学位。2012年至2014年在清华-北大生命科学联合中心从事博士后研究,2014年任中国科学院强磁场科学中心副研究员。2016年起任中国科学技术大学生命科学学院特任研究员。

    主要研究方向是膜蛋白重构与调控。以重要生物学问题和重大疾病密切相关的膜蛋白为研究对象,发展可脱除主链骨架修饰策略,结合蛋白质化学合成技术,实现一系列具有生物活性的中小型膜蛋白体外重构,例如定点翻译后修饰、定点同位素标记等功能化膜蛋白体外重构。同时,基于镜像筛选技术发现新的活性分子/药物前体分子,发展靶向膜蛋白的蛋白质探针工具,结合现代生物化学和生物物理技术,阐释跨膜蛋白结构-功能机制,实现膜蛋白功能的精确调控。在Nature Commun、Nature Protocols、J Am Chem Soc、Angew Chem Int Ed和Acc Chem Res等国际高水平杂志发表(共同)第一作者、(共同)通讯作者论文30余篇。[2]

    个人经历

    受教育经历[2]

    2002/09 - 2006/07,中国科学技术大学,化学,学士,导师:郭庆祥教授

    2006/09 - 2012/07,中国科学技术大学,有机化学,博士,导师:郭庆祥教授

    研究工作经历

    2012/07 - 2014/02,清华大学,化学系,博士后(合作导师:刘磊教授)[3]

    2014/03 -2016/07,中国科学院强磁场科学中心,副研究员

    2016/07-至今,中国科学技术大学,生命科学学院,研究员[2]

    研究兴趣

    1、功能膜蛋白离体重构的新方法发展

    2、功能膜蛋白在体调控的多肽/蛋白探针工具发明

    3、基于镜像蛋白筛选技术的活性分子/药物前体分子发现[2]

    论文作品

    1. Guo, Q. Y.; Zhang, L. H.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Wang, Z. A.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.* Channel activity of mirror-image M2 proton channel of influenza A virus is blocked by achiral or chiral inhibitors.Protein Cell 2018.

    2. Tang, S.; Liang, L. J.; Si, Y. Y.; Gao, S.; Wang, J. X.; Liang, J.; Mei, Z.; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Practical Chemical Synthesis of Atypical Ubiquitin Chains by Using an Isopeptide-Linked Ub Isomer. Angew. Chem. Int. Ed. 2017,56, 13333-13337.

    3. Tang, S.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Cai, X. Y.; Zhang, L. H.; Tian, C. L.*; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Chemical Synthesis of Membrane Proteins via the Removable Backbone Modification Method. Nature Protocols2017,12, 2554-2569.

    4. Li, J. B.; Tang, S.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.*; Liu, L.* Removable Backbone Modification Method for the Chemical Synthesis of Membrane Proteins. Acc. Chem. Res.2017,50, 1143-1153.

    5. Li, J.; He, Q.; Liu, Y.; Liu, S.; Tang, S.; Li, C.; Sun, D.; Li, X.; Zhou, M.; Zhu, P.; Bi, G.; Zhou, Z.; Zheng, J.-S.*; Tian, C.* Chemical Synthesis of K34-Ubiquitylated H2B for Nucleosome Reconstitution and Single-Particle Cryo-Electron Microscopy Structural Analysis. ChemBioChem2017,18, 176-180.

    6. Zheng, J.-S.; He, Y.; Zuo, C.; Cai, X. Y.; Tang, S.; Wang, Z. A.; Zhang, L.-H., Tian, C.-L.*; Liu, L.* Robust Chemical Synthesis of Membrane Proteins through a General Method of Removable Backbone Modification. J. Am. Chem. Soc.2016,138, 3553-3561.

    7. Zuo, C.; Tang, S.; Si, Y.-Y.; Wang, Z. A.; Tian C.-L.; Zheng J.-S.* Efficient synthesis of longer Aβ peptides via removable backbone modification. Org. Biomol. Chem.2016,14, 5012-5018.

    8. Qi Y.-K.; Tang S.; Huang Y.-C.; Pan M.; Zheng J.-S.*; Liu, L.* Hmb(off/on) as a switchable thiol protecting group for native chemical ligation. Org. Biomol. Chem.2016,14, 4194-4198.

    9. Chen, X Tang, S.; Zheng, J. S.; Zhao, R.; Wang, Z. P.; Shao, W.; Chang, H. N.; Cheng, J. Y.; Zhao, H.; Liu, L.*; Qi, H.* Chemical Synthesis of a Two-Photon-Activatable Chemokine and Photon-Guided Lymphocyte Migration in vivo. Nat. Commun.2015,6, 7220-7228.

    10. Qi Y.-K.; Chang H.-N.; Pan K.-M.; Tian C.-L.; Zheng J.-S.* Total Chemical Synthesis of the Site-Selective Azide-Labeled [I66A]HIV-1 Protease.Chem. Commun. 2015,51, 14632.

    11. Zheng, J.-S.; Yu, M.; Qi, Y.-K.; Tang, S.; Shen, F.; Wang, Z.-P.; Xiao, L.; Zhang, L.; Tian, C.-L.*; Liu, L.* Expedient Total Synthesis of Small to Medium-Sized Membrane Proteins via Fmoc Chemistry. J. Am. Chem. Soc.2014,136, 3695-3704.

    12. Zheng, J.-S.; Tang, S.; Qi, Y.-K.; Wang, Z.-P.; Liu, L.* Chemical Synthesis of Proteins Using Peptide Hydrazides as Thioester Surrogates. Nat. Protoc.2013,8, 2483-2495.

    13. Zheng, J.-S.; Tang, S.; Huang, Y.-C.; Liu, L.* Development of New Thioester Equivalents for Protein Chemical Synthesis. Acc. Chem. Res.2013,46, 2475–2484.

    14. Zheng, J.-S.; Chang, H.-N.; Wang, F.-L.; Liu, L.* Fmoc Synthesis of Peptide Thioesters without Post-Chain-Assembly Manipulation. J. Am. Chem. Soc.2011,133, 11080-11083.[2]

    发明专利

    1. 一种化合物及其制备方法及利用其制备多肽的方法。发明人:郑基深、唐姗、司岩岩、刘磊、田长麟。中国专利授权公告号:CN 104744327 A。

    2. 化合物及其制备方法和应用。发明人:刘磊、郑基深、左超、唐姗、田长麟。中国专利申请号:CN 105622424 A。[2]

    科研项目

    1. 国家自然科学基金重大研究计划培育项目,91753120,2018/01-2020/12,主持

    2. 国家自然科学基金大科学装置联合基金项目,U1732161,2018/01-2020/12,主持

    3. 安徽省杰出青年科学基金,蛋白质化学修饰的化学生物学,2018/07-2021/06,主持

    4. 合肥物质科学技术中心方向项目培育基金,2017FXCX002,2018/01-2019/12,主持[2]

    参考资料

    [1] 微尺度物质科学国家研究中心 分子与细胞生物物理研究部 · 微尺度物质科学国家研究中心[引用日期2019-01-17]

    [2] 师资队伍 · 中国科学技术大学生命科学学院[引用日期2018-07-17]

    [3] 2014年度清华大学优秀博士后奖励名单 · 清华大学博士后[引用日期2018-07-25]

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